传递窗是一种洁净辅助设备，主要由于洁净与非洁净区或者非洁净与非洁净区，目的是减少门开的次数，减少细菌的污染，不锈钢传递窗虽然具有杀菌以及减少细菌污染的功效，但是如果在使用一段时间之后不对其内部进行清洁，那么其内部滋生的细菌不但不会起到杀菌的作用，而且还会进一步污染传递窗内的传递物质。
物料进出洁净区，必须严格与人流通道分开，由生产车间物料专用通道进出。物料进入时，原辅料由配制班工序负责人组织人员脱包或外表清洁处理后，经传递窗送至车间原辅料暂存间；内包材料在其外暂存间拆去外包装后，经传递窗送入内包间。车间综合员与配制、内包装工序负责人办理物料交接。通过传递窗传递时，必须严格执行传递窗内外门“一开一闭”的规定，两门不能同时开启。开外门将物料放入后先关门，再开内门将物料拿出，关门，如此循环。洁净区内的物料送出时，应先将物料运送至相关的物料中间站内，按物料进入时的相反程序移出洁净区。所有半成品从洁净区运出，均需从传递窗送至外暂存间，经物流通道转运至外包装间。极易造成污染的物料及废弃物，均应从其专用传递窗运到非洁净区。物料进出结束后，应及时清理各清包间或中间站的现场及传递窗的卫生，关闭传递窗的内外通道门，做好清洁消毒工作。
使用的传递窗专用清洁布、消毒剂擦拭清除传递窗内壁、各角落顶棚、紫外灯管、传递窗门等处污迹，对于污垢堆积厚处可用毛刷、消毒剂刷洗清除污垢，必要时用消毒剂消毒。在有锈钢传递窗的使用过程中用紫外灯照射消毒。要养成定期清洁不锈钢传递窗的好习惯，每星期使用后用消毒剂消毒传递窗内外。当对不锈钢传递窗进行清洁完后，经过专业检查员检查清洁合格后，便会贴挂上“已清洁”状态标示卡，表明可以正常投入使用。